Il dolore è uno dei sintomi più importanti della malattia e frequentemente è anche il primo ad essere notato. E' causato dall'accumulo dei prodotti di scarto nelle cellule nervose.
In molti casi il dolore può essere scatenato da cambiamenti di temperatura, stress o esercizio fisico. Molti pazienti sperimentano due tipi di dolore diversi: un dolore costante di fondo e un dolore acuto.

Il dolore costante (dolore cronico) associato alla malattia di Fabry viene usualmente descritto come un dolore urente che crea un costante fastidio. Questo dolore è avvertito soprattutto nelle mani e nei piedi ed è conosciuto come acroparestesia.

Il dolore acuto associato alla malattia di Fabry è spesso definito come crisi di Fabry. I pazienti descrivono queste crisi come momenti di intenso dolore urente che inizia nei palmi delle mani e nelle piante dei piedi e che si propaga alle altre parti del corpo. Il dolore può durare da qualche minuto a molti giorni.

Il dolore associato alla malattia di Fabry può compromettere le attività quotidiane. L'astenersi da certe attività così come l'utilizzo di farmaci prescritti dal medico possono aiutare a ridurre il dolore.

E' importante che le maestre di bambini affetti siano edotte sulla loro condizione in modo da evitare il più possibile quelle attività che possono scatenare dolore. I pazienti adulti dovrebbero nei limiti del possibile evitare lavori che necessitino di impegno fisico o che prevedano repentini cambiamenti di temperatura o stress emozionali.

Sebbene tali precauzioni possano ridurre gli episodi di dolore non si possono certamente considerare una cura.